在體系運行期間，為審查組織的環(huán)境管理活動是否已按環(huán)境管理體系文件的規(guī)定進行，環(huán)境管理體系是否得到了正確的實施和保持，為確定體系的持續(xù)適用性、充分性、有效性，組織應組織內部審核和管理評審。

貫穿這些工作始終的另一項重要工作是全員培訓。建立和實施環(huán)境管理體系強調全員參與。建立和實施環(huán)境管理體系的任何一個環(huán)節(jié)，都有賴于全體人員共同努力，任何一個員工都不可能游離于體系之外，為使他們都能理解并以實際行動支持體系的建立和運行，組織必須進行充分的培訓，內容從ISO14001標準，到環(huán)境方針，到適用法律法規(guī)，到個人職責，到重要環(huán)境因素，到體系文件，到作業(yè)指導書，到運行記錄……

經過內審和管理評審，組織如果確認其環(huán)境管理體系基本符合ISO14001標準要求，對組織適用性較好，且運行充分、有效，可向已獲得中國環(huán)境管理體系認證機構認可委員會認可有認證資格的認證機構提出認證申請并簽定認證合同，進入ISO14001環(huán)境管理體系認證審核階段。

認證審核是認證機構受組織委托，以第三方身份對組織的環(huán)境管理體系與ISO14001環(huán)境管理體系標準的符合性和運行、保持的有效性進行審核驗證，并確定是否向組織發(fā)放認證證書的過程。

對受審核方的要求：

1、ISO/TS16949:2009認證注冊，只適用于汽車整車廠和其直接的零部件制造商。這些廠家必須是直接與生產汽車有關的，具有加工制造能力，并通過這種能力的實現(xiàn)使產品能夠增值。

2、要求獲得ISO/TS16949：2009認證注冊的公司，必須具備有至少連續(xù)12個月的生產和質量管理記錄，包括內部評審和管理評審的完整記錄。

3、對于一個新設立的加工場所，如沒有12個月的記錄，也可經評審符合確認質量系統(tǒng)規(guī)范要求后，由認證公司可簽發(fā)由NQA頒發(fā)的“符合性證明”。當具備了12個月的記錄后，再進行認證審核注冊。

在現(xiàn)代貿易實踐中，第二方審核早就成為慣例，又逐漸發(fā)現(xiàn)其存在很大的弊端：一個組織通常要為許多顧客供貨，第二方審核無疑會給組織帶來沉重的負擔；另一方面，顧客也需支付相當?shù)馁M用，同時還要考慮派出或雇傭人員的經驗和水平問題，否則，花了費用也達不到預期的目的。唯有ISO9001認證可以排除這樣的弊端。因為作為方申請了第三方的ISO9001認證并獲得了認證證書以后，眾多第二方就不必要再對方進行審核，這樣，不管是對方還是對第二方都可以節(jié)省很多精力或費用。還有，如果企業(yè)在獲得了ISO9001認證之后，再申請UL、CE等產品品質認證，還可以免除認證機構對企業(yè)的質量管理體系進行重復認證的開支。