實驗室凈化工程等級設計也很關鍵，一般的無菌室實驗室潔凈度等級都是萬級，一般普通實驗室則大范圍十萬級~萬級的布局設計。生物實驗室、陽性對照實驗室以及微生物培養(yǎng)實驗室則需按照靜態(tài)百級的潔凈室標準進行設計、施工。

潔凈室按空氣清潔程度分類，如果無塵室的等級只用塵粒數(shù)目來敘述，則可假設塵粒的尺寸為0.5μm，例如，1級、10級、例如100級無塵室塵埃粒子數(shù)目分別小于或等于1顆、10顆、100顆。如果塵粒尺寸不是0.5μm，無塵室等級應以在一特定塵粒尺寸的級數(shù)來表示，分別分為1級、10級、100級、1000級、10000級、100000級，數(shù)值越小，凈化級別就越高。潔凈度越高造價就越高。

潔凈實驗室的外圍護結構如門窗、墻板、吊頂板、過濾器、電器燈具等方面要充分考慮其保溫、隔熱、防火、防潮、密閉性能好的要求，做到不產(chǎn)塵、無裂痕、可擦洗、耐潮濕，板縫平齊密封，壓縫條平直縫隙小。地面則力求做到耐磨、耐沖擊、耐火、耐侵蝕性好，不易產(chǎn)生靜電，表面不易附著塵粒。

萬級無菌室容積小而嚴密，使用一段時間后，室內(nèi)溫度很高，故應設置通氣窗。通氣窗應設在內(nèi)室進門處的頂棚上(即離工作臺zui遠的位置)，為雙層結構，外層為百葉窗，內(nèi)層可用抽板式窗扇。通氣窗可在內(nèi)室使用后、自凈前開啟，以流通空氣。有條件可安裝恒溫恒濕機。