過濾系統(tǒng)包括兩方面，一方面是生化過濾，另一方面是物理過濾。

生化過濾：是以培養(yǎng)為主的過濾方式。

我們常見的就是水妖精(氣動式過濾器)以及上流行的氣舉。其原理就是以多孔隙的濾材上形成高氧區(qū)、水流體，用以培養(yǎng)硝化。

物理過濾：是以抽取缸中肉眼可見廢物。

通過較致密的過濾物，也就是我們常用的過濾棉，用以阻斷大顆粒的廢物再次回到缸內(nèi)。物理過濾過程中也包含有生化過濾過程，因為過濾棉上也會培養(yǎng)硝化生長。常見的就是上濾。

外掛式過濾器 ：外觀一般為盒狀，通常自帶有水泵，一般用于中小或小型魚缸使用，因體其積小、水流強度不高、不會占用缸內(nèi)空間。維護方面比較方便。能常商家叫這為瀑布式過濾系統(tǒng)，效果不太理想，但是袖珍美觀，一般推薦10升以下的水族箱使用。

氣動式過濾：在此種過濾系統(tǒng)中比較有名的應(yīng)該算是惠宏產(chǎn)的水妖精，原理是利用氣舉使水流入過濾體(生化棉、過濾棉)中，進行生物過濾過程。過濾效果還算可以，但是一般須要配合上濾等物理過濾系統(tǒng)使用。多用于小型的繁殖缸、孔雀、短鯛等較少量、小型的魚缸內(nèi)。

太小的缸，或沒有條件添加除油膜硬件，可以放一些“黑瑪莉”，這種上層魚，總是在水面上找食物，同時吞食油膜。也可以定期用一個小杯子壓入水中，杯口貼近水面，讓水面的水溢流到杯中，手工清除油膜。