底部式過濾器：利用底砂砂層作為大體積的濾材(滲流濾層)，通過鋪設(shè)在砂層下的進(jìn)水管道網(wǎng)，經(jīng)由沉水水泵抽水，達(dá)到物理過濾及生化過濾的目地(原理類似于沉水式過濾器)因濾體較大，所以維護(hù)間格時 間較長，但維護(hù)極為不便。效果不錯，缺點是安裝較麻煩，還有草缸無法使用，會照成底肥的嚴(yán)重流失。

氣動式過濾：在此種過濾系統(tǒng)中比較有名的應(yīng)該算是惠宏產(chǎn)的水妖精，原理是利用氣舉使水流入過濾體(生化棉、過濾棉)中，進(jìn)行生物過濾過程。過濾效果還算可以，但是一般須要配合上濾等物理過濾系統(tǒng)使用。多用于小型的繁殖缸、孔雀、短鯛等較少量、小型的魚缸內(nèi)。

滴流與滲流： 滴流式過濾，這種過濾系統(tǒng)多用于溢流式過濾器或上部式滴流盒，其主要特征在于濾材大部份暴露天空氣里，濾材主要以陶瓷環(huán)、生化球、過濾棉為過濾材質(zhì)，進(jìn)行生化過濾過程，過濾倉內(nèi)有流動空氣，但無物理過濾的功能。 滲流式過濾 ，濾材通常為濾棉、生化棉、底砂。主要的特征為濾材基本浸于水體之中，不與空氣直接接觸，起到物理過濾過程，但是在生化棉和底砂之間有較大的空隙，可為消化提供良好的生存環(huán)境，也有一定的生化過濾能力。這兩種過濾系統(tǒng)的過濾效果都很好，但也有缺點，滴流過濾需要在魚缸上部占較大的一塊空間，也不美觀。

魚缸里的水會因魚類的糞便、食物殘渣、水草腐葉而受到污染。在人們想象中將水中看得見的懸浮物過濾掉，使水保持清澈透明就已達(dá)到目的，其實這僅僅只是過濾的初級功能，我們通常稱之為機械過濾。現(xiàn)代的觀賞魚缸過濾應(yīng)是同時具有機械過濾和生物過濾，有時還需要物理過濾。其中尤為重要的是生物過濾。所謂生物過濾，就是通過附著在濾材上的，將溶解在水中的有害物質(zhì)分解或轉(zhuǎn)化為無害物質(zhì)。物理過濾則是利用某些材料特有的吸附功能使水凈化。物理過濾只在特殊情況下短時間使用，如為了去除水中的剩余藥劑等。