商業(yè)保函，是由除銀行以外的，實力雄厚的商業(yè)機構(gòu)出具的保函，一般多為專業(yè)擔保公司開具的公司保函，是商業(yè)機構(gòu)信用擔保。

區(qū)別就是銀行保函是以銀行信用為擔保，承擔人是銀行。而商業(yè)保函是以商業(yè)機構(gòu)信用為擔保，承擔人是商業(yè)機構(gòu)。

保函(Letter of Guarantee, L/G)又稱保證書，是指銀行、擔保公司或個人應申請人的請求，向第三方開立的一種書面信用擔保憑證。保證在申請人未能按雙方協(xié)議履行其責任或義務時，由擔保人代其履行一定金額、一定期限范圍內(nèi)的某種支付責任或經(jīng)濟賠償責任。 保函即為保證書，為了方便，一般公司及銀行都印有一定格式的保證書，其作用包括憑保函交付貨物、憑保函簽發(fā)清潔提單、憑保函倒簽預借提單等。

公司保函就是擔保公司開的保證書，即擔保公司保函，又稱為商業(yè)保函。

擔保公司保函和銀行保函具有相同的法律效力，且擔保公司保函具有費用低，格式靈活，付款方式靈活，辦理周期短等優(yōu)點。采用擔保公司保函代替銀行保函能降低成本，節(jié)約時間。

擔保公司保函的取得較為容易，費用也較低，但由于其本質(zhì)為商業(yè)信用擔保，所以公信力較低。另外，公司保函大多有很強烈的地域特色，某一地區(qū)被承認的擔保公司多是由當?shù)叵嚓P部門如建委等批準，因而其出具的保函也只在本地區(qū)內(nèi)被承認。

銀行保函，由于其出具方的專業(yè)金融性質(zhì)和實質(zhì)擔保的能力更強以及其銀行信用等特點，因而公信力較擔保公司出具的保函更強。所以，許多大型的工程招標過程中，甲方會指定要求乙方出據(jù)銀行保函而非擔保公司保函。與之相對應的是，銀行保函的取得過程相對公司保函而言要求更為嚴格，基本的要求是被保證方必須在保證銀行方有足夠的授信額度，如果沒有授信額度則需要有不低于被保額度的存款準備，并且該存款在保函有效期內(nèi)不可被動用。

目前國內(nèi)銀行保函大多用擔保公司在銀行授信開出，能開銀行履約保函的，基本上只有建行，平安，光大等。部分招標文件要求開到基本戶，涉及到銀行保函的轉(zhuǎn)開，只能建行操作。

通過擔保公司辦理銀行保函不需要存全額保證金，只需要繳納很低一部分費用即可。銀行保函辦理周期更長，費用相對更高。擔保公司保函出函速度更快，費用低，辦理靈活。

商業(yè)保函是由非融資性擔保公司開具的。

首先擔保公司保函和銀行保函具備相同的法律效力，承擔的責任相同，可以完全互換。區(qū)分擔保公司保函和銀行保函就看該保函是誰出具的，即有相關機構(gòu)的公章及相關代表人簽字或印章。