高新技術(shù)企業(yè)專項審計工作從業(yè)務(wù)承接到完成通常要經(jīng)過以下步驟：

1、會計師事務(wù)所和高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位進(jìn)行初步溝通了解，確定高新技術(shù)企業(yè)專項審計目的、審計范圍、審計收費等；并簽訂業(yè)務(wù)約定書；

2、會計師事務(wù)所安排項目組，下發(fā)委托方高新技術(shù)企業(yè)專項審計準(zhǔn)備的資料清單；

3、被審高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位按照資料清單準(zhǔn)備相關(guān)審計資料，并確定現(xiàn)場審計時間。

4、現(xiàn)場審計階段；

5、審計情況匯總和形成審計報告初稿；

6、與被審高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位交換意見；

7 、出具正式審計報告。

申報明細(xì)表又區(qū)別于年度財務(wù)報表。企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細(xì)表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細(xì)表是按照《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》和《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作指引》編制的，其列報的數(shù)據(jù)可以直接反映出企業(yè)是否滿足認(rèn)定條件。

不論企業(yè)以前年度財務(wù)報表是否委托注冊會計師進(jìn)行審計，還是專項審計與年度財務(wù)報表審計是否為同一家會計師事務(wù)所承接，專項審計都可以按照《專項審計指引》獨立實施審計程序。如果結(jié)合以前年度財務(wù)報表審計，確定的重要性水平應(yīng)當(dāng)?shù)陀谙鄳?yīng)財務(wù)報表審計的重要性水平，確定審計范圍時應(yīng)當(dāng)考慮擬利用以前年度財務(wù)報表審計工作中獲取的審計證據(jù)的程度。需要注意的是，應(yīng)當(dāng)結(jié)合具體環(huán)境考慮重要性的性質(zhì)和數(shù)量兩方面的因素。

在財務(wù)報表審計中，一般不專門提及與高新技術(shù)研究開發(fā)費用支出相關(guān)的內(nèi)部控制?！秾ｍ棇徲嬛敢窂娬{(diào)研究開發(fā)費用控制通常屬于申報企業(yè)費用和成本控制的重要組成部分，要求注冊會計師在對研究開發(fā)費用控制進(jìn)行了解時，需要考慮那些影響研究開發(fā)費用完整性、發(fā)生、準(zhǔn)確性和分類的控制點。同時，《專項審計指引》給出了研究開發(fā)業(yè)務(wù)流程通常可能包括的主要活動，如立項和預(yù)算管理、人員管理、材料和設(shè)備管理以及結(jié)項管理等。