高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定專(zhuān)項(xiàng)審計(jì)，是指注冊(cè)會(huì)計(jì)師接受擬向有關(guān)部門(mén)申請(qǐng)進(jìn)行高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定的申報(bào)企業(yè)委托，對(duì)其近三個(gè)會(huì)計(jì)年度(實(shí)際經(jīng)營(yíng)不滿三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限)的研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用結(jié)構(gòu)明細(xì)表和近一個(gè)會(huì)計(jì)年度的高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細(xì)表進(jìn)行審計(jì)，并出具專(zhuān)項(xiàng)審計(jì)報(bào)告。

要求識(shí)別和評(píng)估申報(bào)明細(xì)表層次以及各類(lèi)交易、列報(bào)認(rèn)定層次的重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)。申報(bào)明細(xì)表層次重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)需要從整體上加以判斷，比如，申報(bào)企業(yè)不能提供研究開(kāi)發(fā)項(xiàng)目的相關(guān)計(jì)劃與實(shí)施方案、研究開(kāi)發(fā)記錄，申報(bào)明細(xì)表整體上就可能存在重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)。申報(bào)明細(xì)表層次重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)很可能源于薄弱的控制環(huán)境，特別是凌駕于內(nèi)部控制制度之上時(shí)，很可能偽造或篡改編制申報(bào)明細(xì)表所依據(jù)的會(huì)計(jì)記錄或相關(guān)文件。

在財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)中，一般不專(zhuān)門(mén)提及與高新技術(shù)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用支出相關(guān)的內(nèi)部控制。《專(zhuān)項(xiàng)審計(jì)指引》強(qiáng)調(diào)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用控制通常屬于申報(bào)企業(yè)費(fèi)用和成本控制的重要組成部分，要求注冊(cè)會(huì)計(jì)師在對(duì)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用控制進(jìn)行了解時(shí)，需要考慮那些影響研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用完整性、發(fā)生、準(zhǔn)確性和分類(lèi)的控制點(diǎn)。同時(shí)，《專(zhuān)項(xiàng)審計(jì)指引》給出了研究開(kāi)發(fā)業(yè)務(wù)流程通?？赡馨ǖ闹饕顒?dòng)，如立項(xiàng)和預(yù)算管理、人員管理、材料和設(shè)備管理以及結(jié)項(xiàng)管理等。

對(duì)于市場(chǎng)中的企業(yè)來(lái)說(shuō)，其大多知曉企業(yè)申請(qǐng)成為高新技術(shù)企業(yè)的重要意義。并且，企業(yè)申請(qǐng)成為高新技術(shù)企業(yè)，具備諸多好處和優(yōu)勢(shì)。因此，很多符合條件和要求的企業(yè)，都會(huì)有著申請(qǐng)成為高新技術(shù)企業(yè)的意愿與訴求。而這，就需要開(kāi)展高新技術(shù)企業(yè)審計(jì)。