高新技術(shù)企業(yè)認定審計肯定是在高新技術(shù)企業(yè)的基礎(chǔ)上才能去操作的，所以，想要申報高新技術(shù)企業(yè)認定審計，首先需要認定企業(yè)為高新技術(shù)企業(yè)。一定要先認定為高新技術(shù)企業(yè)，才能申報高新技術(shù)企業(yè)認定審計。

1、凡擬向有關(guān)部門申請進行高新技術(shù)企業(yè)認定的企業(yè)，均需要進行高新技術(shù)企業(yè)認定專項審計；

2、由于高新技術(shù)企業(yè)資格自頒發(fā)證書之日起有效期為三年，期滿前三個月內(nèi)企業(yè)應(yīng)提出復(fù)審申請，不提出復(fù)審申請或復(fù)審不合格的，其高新技術(shù)企業(yè)資格到期自動失效。

所以凡擬向有關(guān)部門申請進行高新技術(shù)企業(yè)復(fù)審的企業(yè)，均需要進行高新技術(shù)企業(yè)認定專項審計。

因此，不管是初次申報還是復(fù)審，都需要進行高新技術(shù)企業(yè)認定專項審計。

申報明細表與年度財務(wù)報表相關(guān)聯(lián)，是指企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細表的相關(guān)數(shù)據(jù)包含在已審計的年度財務(wù)報表中，兩者適用的會計準(zhǔn)則或會計制度是一致的，在相關(guān)會計政策、會計估計方面不存在差異。

基于申請高新技術(shù)企業(yè)認定的目的，申報企業(yè)通常將近三個會計年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細表的專項審計同時委托給一家會計師事務(wù)所，《專項審計指引》要求，針對研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細表分別出具專項審計報告。