高新技術(shù)企業(yè)專項審計工作從業(yè)務(wù)承接到完成通常要經(jīng)過以下步驟：

1、會計師事務(wù)所和高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位進行初步溝通了解，確定高新技術(shù)企業(yè)專項審計目的、審計范圍、審計收費等；并簽訂業(yè)務(wù)約定書；

2、會計師事務(wù)所安排項目組，下發(fā)委托方高新技術(shù)企業(yè)專項審計準備的資料清單；

3、被審高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位按照資料清單準備相關(guān)審計資料，并確定現(xiàn)場審計時間。

4、現(xiàn)場審計階段；

5、審計情況匯總和形成審計報告初稿；

6、與被審高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位交換意見；

7 、出具正式審計報告。

無論是研究開發(fā)費用，還是高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))，在專項審計中都涉及高新技術(shù)的識別。注冊會計師不是高新技術(shù)領(lǐng)域的專家，《專項審計指引》為此做了如下規(guī)定：

(1)恰當界定研究開發(fā)項目、高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))的具體范圍是申報企業(yè)的責任。

(2)申報企業(yè)技術(shù)負責人與企業(yè)法定代表人、財務(wù)負責人共同簽署《管理當局聲明書》。

但《專項審計指引》也規(guī)定，制定總體審計策略時，應(yīng)當清楚地說明向具體審計領(lǐng)域調(diào)配的資源，包括就復(fù)雜的研究開發(fā)項目技術(shù)問題利用專家的工作。

要求識別和評估申報明細表層次以及各類交易、列報認定層次的重大錯報風險。申報明細表層次重大錯報風險需要從整體上加以判斷，比如，申報企業(yè)不能提供研究開發(fā)項目的相關(guān)計劃與實施方案、研究開發(fā)記錄，申報明細表整體上就可能存在重大錯報風險。申報明細表層次重大錯報風險很可能源于薄弱的控制環(huán)境，特別是凌駕于內(nèi)部控制制度之上時，很可能偽造或篡改編制申報明細表所依據(jù)的會計記錄或相關(guān)文件。

對于市場中的企業(yè)來說，其大多知曉企業(yè)申請成為高新技術(shù)企業(yè)的重要意義。并且，企業(yè)申請成為高新技術(shù)企業(yè)，具備諸多好處和優(yōu)勢。因此，很多符合條件和要求的企業(yè)，都會有著申請成為高新技術(shù)企業(yè)的意愿與訴求。而這，就需要開展高新技術(shù)企業(yè)審計。