真空管內的水垢會影響加熱效率，水垢越厚加熱越慢，所以會有太陽能熱水器使用時間越長，加熱越慢的現(xiàn)象。清洗以后水垢消除，加熱時間縮短，節(jié)省電費。水垢會占用水箱容積，水垢厚了，能儲存的熱水量就少了。去除水垢，水箱的熱水儲存量就能越來越多。

磁化除垢法：磁化法水處理是使水流通過一個磁場，然后再流入管道或太陽熱水器系統(tǒng)，經過磁力線切割后，水中的鈣鎂鹽類不能結垢或不能結成堅硬的水垢，而是形成微小的顆粒，隨水流動。磁化除垢是通過磁化方式將已有的水垢清除的過程。磁化除垢的機理有兩個方面：一方面是在磁力作用下，水垢晶體發(fā)生極化，降低了水垢的穩(wěn)定性，使得水垢被不斷地溶解，被水流沖走。

變頻共振除垢法：變頻除垢器能自動產生一種變頻化的電信號，作用于太陽熱水器系統(tǒng)的進水管上，引起管道內水分子產生共振，使氫鍵結合的水分子團變成單個的極性分子，因而提高水的活性。極微小的水分子可以滲透、包圍、溶解、去除熱水器系統(tǒng)內的老垢，同時使懸浮在水中的鈣離子和碳酸根離子相互碰撞，形成其表面無電荷的紋石碳酸鈣晶體，不能吸附在管道上，從而達到除垢、防垢的目的。

夏季水桶內的熱水使用后應及時加滿(放心加水，只要玻璃管內有水就不會爆裂的，玻璃管內的水是放不出來的，除非長期不使用也沒有加水，玻璃管內的水都被蒸發(fā)掉了，這種情況下有太陽照射時是不能加水的)，這樣可以降低水桶內的水溫，減少結垢，如果沒有水溫、水溫顯示儀的話，建議加裝一個，這樣可以方便地查看水桶內的水溫和水位情況。要盡量使水桶內的水溫低于80度，60-70度，這樣就不會產生水垢了。夏季洗衣服、洗碗等都盡量使用熱水，然后及時加滿自來水，以降低水桶內的水溫。夏天如果水桶內的水溫過高，可用防曬網或其它物品將玻璃管罩住，降低太陽的照射。