如果保函中未曾寫明預付款保函的擔保金額，將隨保函歸還金額而相應減少，則很可能出現(xiàn)預付款已大部分償還，而保函額不減的局面，業(yè)主隨時可能全額沒收保函，而承包商卻不擁有全額預付款（因為很可能在業(yè)主沒收保函時，承包商已經(jīng)償還了部分預付款）。

預付款保函的另一個風險是保函的生效時間先于承包商收到的預付款，承包商在不知情的前提下，業(yè)主已經(jīng)沒收預付款保函而承包商未收到預付款。

還有一種可能的風險，就是預付款已經(jīng)扣還完畢，而預付款保函沒有及時撤銷，讓業(yè)主有機可乘，留下沒收保函之機。

工程招投標后為了使交易時更加放心有保障，都會要求對方開具一份預付款保函，這樣既可避免交易中爽約的損失，在任何銀行開具預付款保函的企業(yè)，首先是銀行的開戶會員，然后都必須是合法的企業(yè)有相關的營業(yè)執(zhí)照等合法文件、有足夠的業(yè)務資質等等，然后就可以在銀行申請預付款保函，審核通過后就可以開出了。

《中華人民共和國民法典》 第八百零七條 發(fā)包人未按照約定支付價款的，承包人可以催告發(fā)包人在合理期限內(nèi)支付價款。發(fā)包人逾期不支付的，除根據(jù)建設工程的性質不宜折價、拍賣外，承包人可以與發(fā)包人協(xié)議將該工程折價，也可以請求人民法院將該工程依法拍賣。建設工程的價款就該工程折價或者拍賣的價款優(yōu)先受償。