雙方意愿：申請人和受益人作為保函的主要利益相關(guān)方，若基于自身利益考慮和實際業(yè)務(wù)情況，經(jīng)協(xié)商達成一致，就可以對保函期限進行調(diào)整。例如，申請人希望縮短保函期限以減少擔(dān)保責(zé)任時間，而受益人在評估風(fēng)險后也同意，那么就可以進行相應(yīng)調(diào)整。

項目進度調(diào)整：若項目提前或推遲完成，預(yù)付款的返還或抵扣時間也會相應(yīng)變化，此時可協(xié)商調(diào)整保函期限。如項目提前完工，預(yù)付款提前抵扣完畢，可協(xié)商提前終止保函期限。

從風(fēng)險保障角度看

預(yù)付款保函的核心作用是保障預(yù)付款的，確保在申請人未能按照合同約定使用預(yù)付款或履行相應(yīng)義務(wù)時，受益人能夠得到補償。即使預(yù)付款已經(jīng)使用完畢，但在項目執(zhí)行過程中可能還存在其他與預(yù)付款相關(guān)的潛在風(fēng)險，如因申請人原因?qū)е马椖恐型就?、質(zhì)量不達標(biāo)等情況，可能需要用預(yù)付款進行彌補或扣除相應(yīng)款項，所以保函期限超過預(yù)付款使用期限能為受益人提供更的風(fēng)險保障。

從法律規(guī)定角度看

只要預(yù)付款保函期限的約定是在法律法規(guī)允許的范圍內(nèi)，且是合同雙方真實意思的表示，不存在欺詐、脅迫等違法違規(guī)情形，那么保函期限超過預(yù)付款使用期限是合法有效的，受到法律的保護。我國《民法典》等相關(guān)法律法規(guī)尊重當(dāng)事人的意思自治，允許合同雙方根據(jù)實際情況協(xié)商確定保函期限等條款。