生物潔凈室，主要控制有生命微粒與無生命微粒（塵埃）對工作對象的污染；而生物潔凈室又可分為：

1、一般生物潔凈室，主要控制微生物對象的污染。同時其內部材料要能經受各種劑侵蝕，內部一般保證正壓。實質上其內部材料要能經受各種處理的工業(yè)潔凈室。例：制藥工業(yè)、醫(yī)院（手術室、無菌病房）食品、化妝品、飲料產品生產、動物實驗室、理化檢驗室、血站等。

2、生物學潔凈室：主要控制工作對象的有生命微粒對外界和人的污染。內部要保持與大氣的負壓。例：學、生物學、潔凈實驗室、物物工程（重組基因、疫苗制備）。

B、工業(yè)潔凈室——以無生命微粒的控制為對象。主要控制空氣塵埃微粒對工作對象的污染，內部一般保持正壓狀態(tài)。它適用于精密機械工業(yè)、電子工業(yè)（半導體、集成電路等）宇航工業(yè)、高純度化學工業(yè)、原子能工業(yè)、光磁產品工業(yè)（光盤、膠片、磁帶生產）LCD（液晶玻璃）、電腦硬盤、電腦磁頭生產等多行業(yè)。